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Collections d'histoire naturelle par tomodensitométrie

Pour recueillir des données sur la diversité des formes et des tailles des salamandres, nous utilisons la microtomographie. Dans cette galerie de photos, nous partageons des photos d'une visite récente de l'installation de tomodensitométrie et expliquons comment nous créons des maillages à haute résolution à partir de spécimens d'histoire naturelle.

Viven Louppe
15 décembre 2022
Galeries photos

Pour recueillir des données sur la forme du crâne des spécimens de salamandre, nous utilisons la tomodensitométrie, comme ce micro-scanner. Cela nous permet de collecter des données sur un spécimen de manière non destructive, de sorte que le spécimen reste préservé pour les recherches futures.
Comme la réalisation d'un seul scanner peut prendre plus d'une heure, nous regroupons plusieurs spécimens de salamandre dans un tube en plastique qui sera inséré dans le scanner.
Le scanner utilise des rayons X, qui peuvent facilement traverser des matériaux de faible densité tels que le tissu, la mousse et le plastique. Nous utilisons donc des tampons en mousse et d'autres matériaux pour bien emballer les échantillons afin d'éviter qu'ils ne bougent pendant le scanner.
Voici à quoi ressemble le paquet de spécimens de salamandre lorsqu'il est examiné aux rayons X. Nous pouvons utiliser une prévisualisation des rayons X pour nous assurer que tout est bien aligné avant de commencer le scanner.
Vivien visualise les résultats d'un nouveau micro scanner.
À l'aide du logiciel de tomodensitométrie, nous procédons à une segmentation rapide du scan, qui isole l'os de haute densité des tissus mous de faible densité et des matériaux d'emballage. Cela nous permet de vérifier rapidement que le résultat du scanner est correct.
Le micro scanner nous permet d'obtenir des données anatomiques 3D à haute résolution à partir du squelette complet d'un spécimen de salamandre, sans endommager le spécimen de quelque manière que ce soit.